مقایسه میزان اثر بخشی دو داروی امی پنم و پیرازینامید در مایکوباکتریم توبرکلوزیس

در حال حاضر روش‌های in silico یکی از کم هزینه‌ترین و سریعترین روش‌های موجود جهت طراحی و کشف دارو در زمینه درمان محسوب می گردد. در این مطالعه ما علاقه‌مند شدیم تا با انجام طراحی محاسباتی دارو به روش داکینگ مولکولی ترکیباتی را معرفی کنیم که نقش موثری در مهار عامل اصلی پروتئین زیر واحد بتا RNA پلی مراز در مایکوباکتریوم توبرکلوزیس به عنوان عوامل اصلی مقاومت داروی دارند. بدین منظور ترکیبات ایمی پنم و پیرازینامید که توسط محققین مختلف خواص ضد سل آنها مورد آزمایش قرار گرفته بودند، جمع آوری، و بر اساس جایگاه اتصال آنها به زیر واحد بتا RNA پلی مراز مایکوباکتریوم، آنالوگ‌های جدیدی طراحی شدند. سپس، با استفاده از روش داکینگ مولکولی توسط نرم افزار آکادمیک AutoDock Vina ترکیبات قوی‌تر شناسایی شدند و برهمکنش‌های احتمالی این ترکیبات با جایگاه اتصال زیر واحد بتا RNA پلی مراز آنالیز شد. با توجه به اینکه ترکیبات طراحی شده با مقدار انرژی پایین‌تری به ساختار پروتئین داک شدند، می‌توانند به عنوان ترکیبات بالقوه دارویی مورد ارزیابی‌های بعدی قرار بگیرند.